El objetivo de este trabajo es determinar la incidencia de especies de hongos del genero Aspergillus sp. (formadores de aflatoxinas) en plantas medicinales y bolsas para infusiones, así como evaluar la relación entre la aparición de estos hongos y sus toxinas en dichos sustratos. Se procesaron 24 muestras de plantas medicinales y 20 bolsitas de infusión utilizadas por la población cubana, para determinar la incidencia de especies de hongos del genero Aspergillus sp. así como la producción de aflatoxinas. Se realizó análisis microbiológico utilizando Agar- Malta como medio de cultivo, y se realizó la determinación de aflatoxinas por Cromatografía de Capa Delgada de Alta Precisión. De las muestras estudiadas, aparecieron Aspergillus ustus, A. flavus, A. parasiticus en el 48%, pero la concentración de aflatoxina B₁ detectada no excedió los valores máximos establecidos internacionalmente de 10 ppb. Teniendo en cuenta el creciente uso de las plantas medicinales y los resultados expuestos en este trabajo, se hace necesario establecer nuevas regulaciones en aras de controlar la aparición de estos hongos y sus toxinas en las mismas, aunque para ello se hace necesario validar métodos analíticos rápidos y específicos.